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野生三文魚生存環境競爭十分激烈，為了活下去而疲于奔命，3年之后才能成熟，因此肌肉組織發達，脂肪含量少，肉質柔軟緊實，有種吃瘦肉的感覺；養殖三文魚缺少自然競爭環境和運動空間，飼料都是由高脂肪、高蛋白組成，一般都膘肥體壯，1年不到就可以迅速長到20多斤，魚體肥嫩富含脂肪，魚肉上可以看到非常明顯的白色脂肪線，口感則比較松軟。野生三文魚的營養略高于養殖的。實驗檢測發現，人工養殖三文魚營養也不錯，氨基酸組成全面，氨基酸總量和呈味氨基酸的質量分數都相當高，是一種營養價值很高的食品。

大西洋鮭魚通常在春夏季節的溫暖水流中發育生長，需要3年才能長大，無法滿足市場的需求。科學家使用技術手段，在大西洋鮭魚的受精卵中植入太平洋奇努克三文魚生長激素基因，以及大洋鱈魚抗凍蛋白基因。大洋鱈魚的抗凍蛋白能讓轉基因魚在寒冷環境中繼續分泌生長激素，進而達到生長周期縮短的目標。轉基因三文魚的生長周期可縮短為18個月，且個頭比普通魚更大。美國食品藥品管理局（FDA）在2010年就已完成轉基因三文魚的食品安全評估，目前已經在美國和加拿大獲得批準上市，可以放心食用。