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梔子藍色素因加工工藝的不同，可獲得不同色調的藍色素，顏色從天藍色到海藍色，還有耐酸性和不耐酸的品種，適合于不同的應用環境。

天然的藍色素自然界中是很少有的，梔子藍色素是其中的一種，與合成色素食用亮藍、靛藍相比，其來源天然、人體相容性好，安全性高。是一種值得大力推廣的天然色素。

梔子藍色素在食品、飲料、化妝品中的添加成本并不高，使用量為0.005%-0.01%之間，折算為單位成本約為0.025－0.05元/kg，當然與合成色素相比還是要高一些，合成色素在食品加工中的單位成本幾乎為零，正是因為價格便宜，合成色素在食品上有濫用、超量使用的現象，這對人們的健康是不利的。

我國關于桅子藍色素的研究起步較晚，國內關于桅子藍色素制備的報道不多。桅子藍色素的制備方法可以歸納總結為兩種：一種是在培養基中直接加入粉碎后的桅子果實，將發酵水解與合成一步完成，此種方法不但產品質量不高，而且還造成了桅子黃色素的浪費；另一種方法被稱為兩步法，將桅子藍的水解與桅子藍色素的合成分開，以提高桅子藍色素的質量。